Mağaralar, 10. yüzyıla kadar uzanan 90'dan fazla papa, birkaç hükümdar ve diğer kilise ileri gelenlerinin mezarlarını içermektedir.
Öne Çıkanlar arasında Tahtta Oturan Aziz Petrus'un mermer heykeli, Calixtus III'ün mezar anıtı, Aziz Petrus'un mezarı ve Eski Aziz Petrus Bazilikası'nın kalıntıları yer almaktadır.
Not: Aziz Petrus Bazilikası/Vatikan Müzeleri biletiniz Vatikan Mağaralarına erişimi de içermektedir.